Mastergradsoppgaver i kjemi

DSpace/Manakin Repository

• Home
• Fakultet for naturvitenskap og teknologi
• Institutt for kjemi
• Mastergradsoppgaver i kjemi

Mastergradsoppgaver i kjemi

The collection contains 20 document(s)

Browse by: Titles | Dates | Authors

Show author list

Share on Facebook

 

Recent additions

• Karakterisering av kommersielle omega-3 produkter og utvikling av en ny metode for separasjon av lipidklasser med fast-fase ekstraksjon

  Ovesen, Marte Stokvik (Master thesis; Mastergradsoppgave, 15-Nov-2012)

  [+]

  [-]

  Abstract:

  Kliniske studier viser at inntak av omega-3 fettsyrene EPA, DPA og DHA kan bidra til å forebygge hjerte- og karsykdommer, redusere inflammasjon, påvirke sentralnervesystemets funksjon positivt og bidra til en rekke andre helsegevinster. Som en konsekvens har markedet for kommersielle omega-3 produkter økt de siste tiårene. Det ble kjøpt inn 10 produkter til dette studiet. Produktene baserte seg på konsentrert fiskeolje, selolje, krillolje, tran og en blanding av tran og konsentrert fiskeolje. Varedeklarasjonene synes å være mangelfull ettersom det bare opplyses om mengde EPA/DPA/EPA per dose, og ikke hvilke andre fettsyrer produktene inneholder og mengden av disse. Dessuten opplyser de færreste om hvilke lipidklasser fettsyrene er forestret i. Hovedmålet for oppgaven ble derfor å bestemme fettsyresammensetningen i produktene, bestemme prosentandelen av de ulike fettsyrene og å bestemme hvilke lipidklasser de ulike produktene inneholdt. Det skulle også gjøres en klassespesifikk analyse av fettsyresammensetningen. Ettersom teknikkene for separasjon av lipidklasser anses å være utstyrskrevende og tidskrevende ble delmål for oppgaven å lage en ny metode for å separere lipidklasser til videre analyse. Det ble brukt GC-FID til analyse av fettsyresammensetning og bestemmelse av arealprosent. Til separasjon av lipidklasser ble det forsøkt preparativ HPTLC og fast-fase ekstraksjon på silika. Lipidklassene som ble funnet var sammenlagt mono, di- og triacylglyseroler, fosfolipider, frie fettsyrer, etylestere, kolesterylestere og/-eller voksestere og kanskje kolesterol. For fiskeoljene, tran og selolje dominerte triacylglyseroler, for blandingen av tran og konsentrert fiskeolje var innholdet 50/50 etylestere og triacylglyseroler og for krilloljene dominerte fosfolipidene. Fettsyresammensetningen i produktene viste seg å være svært lik. Det var derimot stor variasjon i prosentandelen av de ulike fettsyrene og prosentandelen EPA, DPA og DHA varierte mellom ca. 70 og 15 %. Det var også store variasjoner i prosentandelen mettede og enumettede fettsyrer, mens prosentandelen flerumettede fettsyrer utenom EPA, DPA og DHA ikke varierte i stor grad. Det lyktes ikke å separere lipidklassene med preparativ HPTLC fordi det måtte appliseres for mye olje til at platen var i stand til å gi en god separasjon. Det lyktes heller ikke å lage en god metode for separasjon av lipidklasser med fast-fase ekstraksjon med silika som stasjonærfase, kanskje på grunn av for lav oppløsningsevne. Noen av lipidklassene ble imidlertid høvelig separert med den ene metoden som ble prøvd og fire av fraksjonene ble kjørt på GC-FID for FAME analyse. Resultatene av dette viste at det verken var stor forskjell i fettsyresammensetningen eller prosentandelen av fettsyrer i de ulike fraksjonene.

  URI:

  http://hdl.handle.net/10037/5094

  File(s) in this item: 1

  thesis.pdf   (2.287Mb)
• Inhibition study of Vibrio cholerae Endonuclease I

  Sivertsen, Annfrid (Master thesis; Mastergradsoppgave, 15-May-2008)

  [+]

  [-]

  Abstract:

  The Vibrio cholerae bacteria resistance against introduction of new genetic material through transformation is caused mainly by a small extracellular or periplasmic endonuclease of type I, the VcEndA of 24.7 kDa coded by the dns gene, (Focareta et al, 1987; Focareta et al, 1991; Altermark et al, 2007b). The VcEndA homologues in other bacteria, Serratia marcescens (Timmins et al, 1973), Erwinia chrysanthemi (Moulard et al, 1993), Aeromonas hydrophila (Chang et al, 1992), Vibrio vulnificus (Wu et al, 2001) and Vibrio salmonicida (Altermark et al, 2007b), are identified as the main mechanisms of preventing a successful transformation in these organisms. Of a broader commercial interest is the identification of the EndoI in Esterichia coli, that shares 60 % sequence identity with VcEndA (Jekel et al, 1995). This project aims to find a lead compound for an inhibitor that is commercially exploitable, and will be applied as an additive in a transformation kit that prevents nuclease activity. An inhibitior would increase the yield in transformation procedures, and delete the step of creating endonuclease type I negative strains prior to transformation experiments. As a starting point, the Hepes molecule known to decrease the activity of VcEndA and the homologues VsEndA from Vibrio salmonicida (Altermark, Ph.D thesis 2006), was used as a template to find more active compounds. In this thesis I report the work and results from an in vitro screening of selected compounds with similar structural features as the Hepes molecule, and their activity measured by IC50 values. I also report an X-ray crystallography study with both soaked and co-crystallized approaches, and observed changes in the active site of the catalytic important residues Arg99 and Glu113 upon binding of an inactive compound. Computational modeling experiments with molecular docking, and comparison of the performance of three different docking programs, GOLD, AutoDock and Glide are carried out. To find more novel active compounds, a virtual screening by the program GOLD was performed with two libraries of small molecules. By the activity measurements, three compounds with the consensus feature of an aminoethanesulfonic acid group followed by a hetero- or homo cyclohexane ring were identified. In the structures from data sets collected from soaked crystals, the inactive molecule cacodylate was found bound in the active site. Observation of a change in the conformations of residue Arg99 and the nearby Glu113 is shown for two data sets compared to an empty site. The formation of a salt bridge between Arg99 and Glu113 shows similarity to the findings of Arg99 conformations in dsDNA-VVn complexes of the close homologous endonuclease type I, Vvn in Vibrio vulnificus (Wu et al, 2001; Li et al, 2003). The comparison of the molecular modeling programs GOLD, AutoDock and Glide indicate that GOLD is most suited to perform modeling experiments of the VcEndA system. This program is able to differentiate between active and inactive compounds upon assigning fitness scores, as well as consistently treat active compounds by assigning similar docking poses. The program AutoDock is also considered to give satisfactory docking poses, but are penalized for not consistently differentiate between active and inactive compounds when assigning fitness scores. The results from the docking experiments and the virtual screening strengthen the interpretation of the IC50 values, the consensus structural features and the changes in Arg99 upon binding of the inactive compound cacodylate.

  URI:

  http://hdl.handle.net/10037/4908

  File(s) in this item: 1

  thesis.pdf   (1.725Mb)
• A new fluorous-tagged porphyrinoid

  Larsen, Simon (Master thesis; Mastergradsoppgave, 16-Aug-2012)

  [+]

  [-]

  Abstract:

  The field of corrole chemistry has flourished over the past decade. Simple and high-yielding procedures have made the corrole ligand readily available, and several procedures on how to functionalize and otherwise modify corroles and their metal complexes have been reported. During an attempt to synthesize corrole from a fluorous tagged aromatic aldehyde a new porphyrinoid has been isolated from the pyrrole-aldehyde condensation, proving that pyrroles and aromatic aldehydes are indeed capable of self-assembling into a variety of macrocycles. This new porphyrinoid is believed to be an isosmaragdyrin, which would be the first report of a smaragdyrin synthesized from a one-pot procedure.

  URI:

  http://hdl.handle.net/10037/4626

  File(s) in this item: 1

  thesis.pdf   (1.672Mb)
• Ring closing reactions of barbituric acid derivatives

  Kasiulis, Evaldas (Master thesis; Mastergradsoppgave, 08-Jun-2012)

  [+]

  [-]

  Abstract:	Ring closing reactions of barbituric acid derivatives
  URI:	http://hdl.handle.net/10037/4407

  File(s) in this item: 1

  thesis.pdf   (2.765Mb)
• Attempted syntheses of 1,3,4,6-tetrasubstituted-2,5-diketopiperazines using microwave assisted heating

  Grineviciute, Laima (Master thesis; Mastergradsoppgave, 08-Jun-2012)

  [+]

  [-]

  Abstract:	Attempted syntheses of 1,3,4,6-tetrasubstituted-2,5-diketopiperazines using microwave assisted heating
  URI:	http://hdl.handle.net/10037/4379

  File(s) in this item: 1

  thesis.pdf   (2.043Mb)

Search Munin

Browse

Help