Design av en transkripsjonssensor i Escherichia coli : til deteksjon av virkningsmåten til nyoppdagede antimikrobielle peptider

Abstract

Antibiotikaresistens er vurdert som den største trusselen knyttet til behandling av de smittsomme sykdommene i den vestlige verden, på grunn av økningen i infeksjoner som følge av multiresistente bakterier. Nylige sykdomsutbrudd forårsaket av bakterier med total eller delvis resistens mot tilgjengelige antibiotika, kan være meget alvorlige siden mulighetene for behandling er svært begrenset. Marin bioprospektering er utforskning av marine kilder med hensikt å finne biologisk aktive forbindelser som kan benyttes i forskning og utvikling av nye medisiner. Målet med denne oppgaven var å lage en biosensor for detektering av virkningsmåten til nyoppdagede antimikrobielle peptider i E. coli. En slik sensor vil kunne gjøre arbeidet med testing av nyoppdagede antimikrobielle peptider lettere og mer effektiv. Det ble benyttet bioteknologiske arbeidsmetoder for å inkorporere egnede reportergener kodende for fluorescerende proteiner, i et system hvor fargene kunne avleses i en fluorescensplateleser. Innledende tester tyder på delvis funksjonalitet, men systemet krever tilpasninger i både promotorvalg og valg av fluorescerende proteiner. Videre arbeid involverer finjustering av systemene for å unngå bakgrunnssignaler fra bakterier og dyrkningsmedie. Det gjenstår også arbeid med inkorporering i en E. coli villstamme, for å kunne måle direkte påvirkning av cellulære prosesser i villstammer av E. coli.