dc.contributor.advisor | Nilssen, Øivind | |
dc.contributor.author | Østern, Rune André Helland | |
dc.date.accessioned | 2014-12-23T13:43:01Z | |
dc.date.available | 2014-12-23T13:43:01Z | |
dc.date.issued | 2014-09-19 | |
dc.description.abstract | CMT is a common inherited disease of the peripheral nerves that may be caused by mutations in multiple genes, most are rare. Our aim was to describe the spectrum of mutations and genes in Norwegian CMT patients, identify factors associated with diagnostic findings, revise the testprotocol, and evaluate the assessments of genetic variants of uncertain clinical significance. Furthermore, we searched to identify the disease associated gene in a large family with a CMT2-like-disorder. We evaluated the data given in laboratory request forms accompanying 559 samples sent for CMT testing during a seven year period. Diagnostic testing was in compliance with recommended algorithms. In paper I we suggest a simplified algorithm intended for diagnostic CMT testing in referral laboratories. Segregation analysis of twenty-two relatives (9 affected) from eight families led to the reclassification of four sequence variants of uncertain clinical significance (paper II). The results of paper II demonstrate the importance of precise clinical data, particularly when investigating variants of uncertain clinical significance. In paper III we performed whole genome linkage analysis, haplotype analysis, SOD1 sequencing and clinical and neurophysiological investigations in a large kindred with a CMT2-like-disorder. The mutation c.140A>G, p.His47Arg in SOD1 segregated with the disease. The results of paper III illustrate the complex genetic etiology of lower motor neuron disease, and identify a common cause of CMT2-like disease in Norway. | en |
dc.description.doctoraltype | ph.d. | en |
dc.description.popularabstract | CMT er en vanlig arvelig sykdom i de perifere nerver. Sykdommen er assosiert med mutasjoner i mange ulike gener, de fleste genene er enkeltvis sjeldne årsaker til CMT. Vårt mål var å beskrive spekteret av mutasjoner og involverte gener i den norske CMT populasjonen, identifisere faktorer som er assosiert med et positivt funn ved genetisk testing, revidere protokollen som brukes i CMT testing og evaluere familiestudiene gjort i vurderingen av sekvensvarianter av usikker betydning. Videre ville vi identifisere det sykdomsassosierte genet i en stor norsk familie med CMT2-lignende sykdom.
Vi analyserte data angitt i rekvisisjonsskjemaene som fulgte 559 blodprøver tilsendt for CMT testing over syvårsperioden fra 2004-2010. Diagnostisk testing ble gjort i henhold til anbefalt algoritme og inkluderte undersøkelser av PMP22dup og sekvensering av MPZ, EGR2, LITAF, NEFL, PMP22, GJB1 og MFN2. I artikkel I foreslår vi en forenklet algoritme for CMT testing for diagnostiske sentre som får tilsendt blodprøver. For å se om påviste sekvensvarianter med usikker betydning var assosiert med flere sykdomstilfeller i den enkelte familie gjorde vi segregasjonsanalyser av 22 slektninger (ni affiserte) fra åtte familier. Det førte til reklassifisering av fire sekvensvarianter av usikker betydning (artikkel II). Resultatene i artikkel II understreker betydningen av presise kliniske data, spesielt når man skal undersøke sekvensvarianter av usikker betydning. I artikkel III utførte vi helgenomisk koblingsanalyse, haplotype analyse og sekvensering av SOD1 samt kliniske og nevrofysiologiske undersøkelser i en stor familie med mange tilfeller av CMT2-lignende sykdom. Mutasjonen c.140A>G, p.His47Arg i SOD1 segregerte med sykdommen. Resultatene i artikkel III illustrerer hvor sammensatt de genetiske årsakene til sykdommer i nedre motor nevron er, og identifiserer en ny vanlig årsak til CMT2-lignende sykdom i Norge. | en |
dc.description.sponsorship | Norges Forskningsråd, stipend #199372 og Foreningen for Muskelsyke | en |
dc.description | Paper III of the thesis is not available in Munin: <br>III: Rune Østern, Toril Fagerheim, Kristin Ørstavik, Trygve Holmøy, Arvid Heiberg, Inger Lund-Petersen, Tim M. Strom, Øivind Nilssen and Arve Dahl: ‘Hereditary motor neuron disease in a large Norwegian family with a “H46R” substitution in the superoxide dismutase 1 gene’, Neuromuscular Disorders, Volume 22, Issue 6, June 2012, pages 511–521, available at <a href=http://dx.doi.org/10.1016/j.nmd.2012.01.011>http://dx.doi.org/10.1016/j.nmd.2012.01.011</a> | en |
dc.identifier.uri | https://hdl.handle.net/10037/6965 | |
dc.identifier.urn | URN:NBN:no-uit_munin_6561 | |
dc.language.iso | eng | en |
dc.publisher | UiT The Arctic University of Norway | en |
dc.publisher | UiT Norges arktiske universitet | en |
dc.rights.accessRights | openAccess | |
dc.rights.holder | Copyright 2014 The Author(s) | |
dc.rights.uri | https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/3.0 | en_US |
dc.rights | Attribution-NonCommercial-ShareAlike 3.0 Unported (CC BY-NC-SA 3.0) | en_US |
dc.subject | VDP::Medisinske Fag: 700::Basale medisinske, odontologiske og veterinærmedisinske fag: 710::Medisinsk genetikk: 714 | en |
dc.subject | VDP::Medical disciplines: 700::Basic medical, dental and veterinary science disciplines: 710::Medical genetics: 714 | en |
dc.subject | VDP::Medisinske Fag: 700::Klinisk medisinske fag: 750::Nevrologi: 752 | en |
dc.subject | VDP::Medical disciplines: 700::Clinical medical disciplines: 750::Neurology: 752 | en |
dc.title | Charcot-Marie-Tooth disease (CMT): statistical analysis and revision of molecular genetic diagnostics in a patient population and identification of the disease locus in a large Norwegian family with CMT. | en |
dc.type | Doctoral thesis | en |
dc.type | Doktorgradsavhandling | en |