ub.xmlui.mirage2.page-structure.muninLogoub.xmlui.mirage2.page-structure.openResearchArchiveLogo
    • EnglishEnglish
    • norsknorsk
  • Velg spraaknorsk 
    • EnglishEnglish
    • norsknorsk
  • Administrasjon/UB
Vis innførsel 
  •   Hjem
  • Norges arktiske universitetsmuseum og akademi for kunstfag
  • Norges arktiske universitetsmuseum
  • Artikler, rapporter og annet (Universitetsmuseet)
  • Vis innførsel
  •   Hjem
  • Norges arktiske universitetsmuseum og akademi for kunstfag
  • Norges arktiske universitetsmuseum
  • Artikler, rapporter og annet (Universitetsmuseet)
  • Vis innførsel
JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

Shotgun-sequencing of plant DNA: Selection og material and methods

Permanent lenke
https://hdl.handle.net/10037/30847
Thumbnail
Åpne
article.pdf (608.2Kb)
(PDF)
Dato
2017
Type
Conference object
Konferansebidrag

Forfatter
Merkel, Marie Kristine Føreid; Pitelkova, Iva; Lammers, Youri; Coissac, Eric; Alberti, Adriana; Dossat, Carole; Kirchefer, Andreas; Alsos, Inger Greve
Sammendrag
Initially, rbcLaand ITS2 were PCR amplified and Sanger sequenced for 564 species from 1900 specimens. To increase the amount of the genome covered, shotgun sequencing of 1670 species is in progress. Our Sanger analyses had a success rate of 74% and 85% for ITS2 and rbcLa, respectively. Overall success rate of Sanger sequencing decreased with later collection date in the year. Preliminary results of the shotgun sequencing and assembly of 277 specimens gives a success rate of 82% and 72% for rbcL and matK, respectively. Constructing a reference sequence library consisting of not only a few bar code loci, but full plastid and ribosomal sequences is beneficial as it provides a valuable resource for novel research avenues.
Metadata
Vis full innførsel
Samlinger
  • Artikler, rapporter og annet (Universitetsmuseet) [425]

Bla

Bla i hele MuninEnheter og samlingerForfatterlisteTittelDatoBla i denne samlingenForfatterlisteTittelDato
Logg inn

Statistikk

Antall visninger
UiT

Munin bygger på DSpace

UiT Norges Arktiske Universitet
Universitetsbiblioteket
uit.no/ub - munin@ub.uit.no

Tilgjengelighetserklæring